火炬接力1點10分在舊金山海灣邊的48號碼頭舉行點火儀式，儀式持續五分鐘，原定沿海濱的英巴克德諾大道南行6公里，最終到達傑斯汀·荷曼廣場舉行結束儀式。在英巴克德諾大道沿路聚集了大量的抗議、歡迎以及觀看的民眾，在傑斯汀·荷曼廣場更有數千人等待火炬的來臨。

第一位接過奧運火炬的女選手，跑入了48號碼頭的一個倉庫型建築後，火炬失去蹤影，在各方都在猜測火炬去處的25分鐘後，一輛大巴士在警察摩托的引導下開出建築，尾隨的警車有5-6倆，遠離英巴克德諾大道而去。

10分鐘後，車隊在兩公里外的佛納斯大道和潘恩大道停下來，大約30個騎警排成左右兩列，再外由另外約40位步行的警察又分成兩列，火炬手由約8位身著運動衫的中外特警圍繞，開始接力傳遞。此時周邊除了路過的路人之外，不再有為奧運火炬而來的觀眾。

火炬接力沿南北縱貫舊金山中心的佛納斯大道向北跑，在跑過數個街區後，開始有抗議和歡迎的少數人趕到，有一個舉著雪山獅子旗的藏人試圖靠近隊伍，在外圍很快被警察推開。接力隊伍沿著佛納斯大道北行，西轉上海灣街，經樂古納街，馬瑞納街，最後轉上高速公路多尤路，所有接力的火炬手都從大巴士上下來以及回去，之前有五位火炬手退出了今天的火炬接力，接力在多尤路上結束。

此時，接力車隊在多尤路上停留了約40分鐘，然後轉入19街，從舊金山西部南下，轉東離開了舊金山，駛向舊金山國際機場。據悉閉幕儀式將在舊金山國際機場舉行。

在倫敦和巴黎支持西藏和中國人權的民眾阻止並發生5次熄滅奧運火炬之後，4月8日舊金山市長蓋瑞·紐森，發言表示將可能改變火炬傳遞路線。但是，此次改變的幅度還是讓民眾大跌眼鏡，一位民眾表示：他們應該保持原計劃，至少應該那樣做，我很失望，他們好像躲到哪裡去了，他們為什麼要躲藏呢？

另一位民眾說：我為每個人感到失望，這很丟臉，不應該發生這樣的事，他們害怕發生什麼，而讓成千的人沒有機會看到，這很悲哀。